Před použitím důkladně propereme molitan ve vlažné vodě. Na vnitřní stěnu akvária připevníme pomocí přísavek filtr a molitan na něj nasadíme. Molitan pereme pod tekoucí vodou dle zarybnění nádrže každý týden až 14 dní. Při vytahování molitanu si můžeme vypomoci menším polyetylenovým sáčkem, který na filtr nasadíme ještě v akváriu. Zabráníme tím splavování nečistot zpět do akvária.  
Přívod vzduchu do směrovače seřídíme tak, aby potrubím proudil stejnoměrný tok vzduchu a vody. Největší účinnosti se dosáhne, prochází-li hladina vody středem kolínka. Pokud kolínko nepoužíváte, musí být konec potrubí pod hladinou vody v akváriu.